Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cldn18P56857 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Cldn18P56857 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cldn18P56857 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Cldn18P56857 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn18P56857 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn18P56857 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms