Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Irf5P56477 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irf5P56477 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms