Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CdaP56389 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CdaP56389 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CdaP56389 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CdaP56389 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CdaP56389 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CdaP56389 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CdaP56389 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CdaP56389 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CdaP56389 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CdaP56389 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CdaP56389 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms