Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Faf1P54731 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Faf1P54731 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms