Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PctpP53808 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PctpP53808 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PctpP53808 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PctpP53808 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PctpP53808 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PctpP53808 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PctpP53808 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PctpP53808 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms