Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lhx4P53776 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lhx4P53776 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms