Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1cP52432 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1cP52432 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms