Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ClgnP52194 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ClgnP52194 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms