Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccr5P51682 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccr5P51682 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccr5P51682 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms