Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FmodP50608 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FmodP50608 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FmodP50608 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FmodP50608 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FmodP50608 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FmodP50608 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FmodP50608 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FmodP50608 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms