Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srp9P49962 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Srp9P49962 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp9P49962 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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