Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CtshP49935 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CtshP49935 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtshP49935 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtshP49935 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CtshP49935 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtshP49935 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtshP49935 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtshP49935 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtshP49935 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtshP49935 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtshP49935 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtshP49935 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CtshP49935 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms