Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cav1P49817 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cav1P49817 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Cav1P49817 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cav1P49817 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms