Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnni3P48787 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnni3P48787 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms