Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cox8bP48772 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cox8bP48772 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms