Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TgfaP48030 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TgfaP48030 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TgfaP48030 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms