Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf4P43488 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf4P43488 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf4P43488 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnfsf4P43488 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms