Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Elk1P41969 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms