Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms