Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VhlP40338 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VhlP40338 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VhlP40338 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VhlP40338 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VhlP40338 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VhlP40338 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VhlP40338 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VhlP40338 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VhlP40338 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VhlP40338 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VhlP40338 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms