Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Upk2P38575 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Upk2P38575 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms