Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig1P37913 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lig1P37913 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lig1P37913 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lig1P37913 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lig1P37913 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lig1P37913 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lig1P37913 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms