Protein–RNA interactions for Protein: P36993

Ppm1b, Protein phosphatase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1bP36993 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppm1bP36993 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppm1bP36993 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms