Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hes1P35428 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hes1P35428 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms