Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mmp12P34960 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mmp12P34960 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms