Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Apoc1P34928 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoc1P34928 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms