Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Saa4P31532 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms