Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa2P31245 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa2P31245 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms