Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cdk4P30285 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk4P30285 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms