Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd3P30282 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccnd3P30282 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms