Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VtnP29788 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VtnP29788 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VtnP29788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VtnP29788 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VtnP29788 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VtnP29788 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms