Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RxraP28700 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RxraP28700 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RxraP28700 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RxraP28700 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RxraP28700 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RxraP28700 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RxraP28700 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RxraP28700 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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