Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc6a9P28571 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a9P28571 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms