Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LoxP28301 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LoxP28301 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LoxP28301 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LoxP28301 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LoxP28301 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms