Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-DMaP28078 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms