Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pde6aP27664 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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