Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpl3P27659 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl3P27659 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms