Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnrpbP27048 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnrpbP27048 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms