Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ggta1P23336 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms