Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PparaP23204 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PparaP23204 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PparaP23204 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PparaP23204 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PparaP23204 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PparaP23204 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PparaP23204 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PparaP23204 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PparaP23204 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PparaP23204 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PparaP23204 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PparaP23204 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PparaP23204 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms