Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gna11P21278 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gna11P21278 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gna11P21278 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gna11P21278 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gna11P21278 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gna11P21278 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gna11P21278 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gna11P21278 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms