Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BdnfP21237 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BdnfP21237 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms