Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxb9P20615 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxb9P20615 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms