Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ntf3P20181 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms