Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P18530 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P18530 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P18530 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P18530 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18530 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18530 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18530 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms