Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtsdP18242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtsdP18242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsdP18242 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CtsdP18242 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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