Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms