Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabra6P16305 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabra6P16305 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms