Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp53P15975 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms