Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fv4P11370 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fv4P11370 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fv4P11370 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms